Três anos após o epísodio II e a guerra clônica continua. Durante essa guerra muita coisa acontece. O General Grievous e o Conde Dooku, agora Darth Tyranus, sequestram Palpatine. Obi-Wan e Anakin resgatam o chanceler e matam Dooku. Após isso Obi-Wan elimina Grievous em Utapau. E aí começa o perigo. Mace Windu tenta matar Palpatine, que se revelou o Sith Lord, mas Anakin impede e mata o mestre Jedi. Atraido pelo lado sombrio, Anakin se torna Vader e Obi-Wan juntamente com Yoda devem impedir a destruição da repúplica e dos Jedi.
